Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC2P02655 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC2P02655 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms