Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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