Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms