Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA3O96018 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA3O96018 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA3O96018 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA3O96018 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA3O96018 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APBA3O96018 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APBA3O96018 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA3O96018 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms