Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP2O95045 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms