Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L1O75177 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms