Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms