Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms