Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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