Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms