Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CREB3O43889 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3O43889 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms