Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms