Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DENRO43583 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms