Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms