Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QR89 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QR89 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QR89 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms