Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BML4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BML4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BML4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BML4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BML4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms