Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms