Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms