Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DXG7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DXG7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
B4DXG7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms