Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms