Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms