Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms