Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L5A6NJ08 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L5A6NJ08 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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