Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35F4A4IF30 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms