Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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