Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A087WUJ7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms