Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms