Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP16Q9Y5T5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms