Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSAG2Q9Y5P2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms