Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED16Q9Y2X0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms