Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP22Q9UPT9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms