Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms