Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms