Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms