Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC9Q9UKV0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms