Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPC1L1Q9UHC9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms