Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KB2Q9UBS0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms