Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms