Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms