Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms