Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms