Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CWC25Q9NXE8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms