Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms