Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms