Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms