Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms