Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms