Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf4Q9NQ89 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms