Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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LHX9Q9NQ69 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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LHX9Q9NQ69 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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LHX9Q9NQ69 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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LHX9Q9NQ69 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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LHX9Q9NQ69 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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