Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRHQ9HD43 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRHQ9HD43 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms